Pepechico

Diminutivo de José Francisco.
Ver CHICO, PEPE.

Panta

Diminutivo de Pantaleón.

Nati

Diminutivo de Natividad.Igual que en España.

Nacho (2)

Diminutivo de Ignacio.
Igual que en España.

Mencho

Diminutivo de Clemente, Clemencia, Nemesio y Juvencio.

Male

Diminutivo de Magdalena.

Lupe

Diminutivo de Guadalupe.
Igual que en España.

Goyo

Diminutivo de Gregorio.
Igual que en España.

Chimo

Diminutivo de Joaquín.

Chima

Diminutivo de Joaquina.

Chico (2)

Diminutivo de Francisco y Francisca.
PACO y PACA también son diminutivos comunes para estos nombres.  Tengo la impresión que lo de CHICO es más habitual en el sudeste del país, aunque realmente no he tenido oportunidad de contrastarlo.
En cualquier caso, creo que lo de PEPECHICO como diminutivo de José Francisco es inmejorable.

Cheto

Diminutivo de Aniceto.

Chepe

Diminutivo de José y Josefa.

Chente

Diminutivo de Vicente y Vicenta.

Chendo

Diminutivo de Rosendo.

Chema

Diminutivo de José María.
Igual que en España.

Chelo

Diminutivo de Consuelo.
Igual que en España.

Chencho

Diminutivo de Cresencio o Inocencio.

Chamba (2)

Diminutivo de Salvador.

Chalo

Diminutivo de Gonzalo.